結論から言うと、ついている位置以外に、現状違いはほぼないと思います。
でもついてる位置が違う、というのは、その部分だけみたら、たいした違いではないと感じます。でも進化の目からみていくと、「由来が違う」というのは生物的に見ると大変大きな違いです。
例えばヒトの足と昆虫の足。役割で言えば同じですが、その発生的な由来は違いますね。こうした器官を相似器官、といいます。花弁とがくも、「由来が違う」という意味では、足の例と同じです。

花は、葉が変形してできたもの、とご存じかも知れません。
単純化して言えば、４種類の葉が、がく、花弁、おしべ、めしべの４つへ変化しました。茎についている順でいうと、下から、その４つになります。ユリの場合、たまたま他人のそら似（？）でがくと花弁が見かけ・役割ともほとんど同じになりましたが、ついている場所が違うということは、元々は由来が違っていることを示しているのです。

が、子どもに説明するとしたら、どこまで意訳していうか、それとも「今は場所以外には違わないね」というか、相手の年齢や理解度によって説明の仕方も変わる部分かも知れません。

生物などの質問の「なぜ？」というのは難しいものが多いです（笑）。
生物が「なぜ」それをするようになったのか。その目的についての質問です。それは、本当のところはその生物に聞かないと分かりません。しかし「こういうメリットがある」と考える事はできます。本当にその目的でやったかどうかはさておき、理屈の上ではこう考えられる、というヒト目線での考えではありますが。

無性生殖では、素早く仲間を多く増やすことが可能です。しかしクローンであり、遺伝子的にも同一なため、不都合な環境になったときに一度に全滅する可能性があります。
有性生殖では、遺伝子のバリエーションが増えるため、環境変化があったとき、生存確率が高まります。面倒な手順や繁殖効率が無性生殖に比べて低い、という側面はあります。
結局、どちらも行うということは、両方を使い分けるメリットがあるためなのではないでしょうか。